Një incidenti i ka ndodhur Papa Franceskut gjatë vizitës së tij në Kili. Papa Francesku është goditur me një objekt në fytyrë gjatë përshëndetjes së tij me njerëzit. Mësohet se Papa nuk ka marrë lëndime nga ky akt.
Vizita e Papës në Kili është prishur nga dhuna, pasi 30 persona u arrestuan pas përleshjeve të zemëruara në rrugë, u thirr policia e trazirave dhe sulmoi zjarrvënësit ndaj kishave.
Turneu i tij i gjashtë në Amerikën e Jugut ka provokuar një reagim nga aktivistët pro-abortit dhe protestuesit të zemëruar nga kostoja e madhe e vizitës.
