Seksi anal ka rreziqe më të larta për përhapjen e infeksioneve seksualisht të transmetueshme (IST) krahasuar me aktivitetet e tjera seksuale.
Kjo për faktin se cipa e brendshme e anusit është e hollë dhe lehtësisht e dëmtueshme dhe si rrjedhojë më e prekshme nga infeksionet.
IST-të që mund të transmetohen përmes seksit anal përfshijnë: mykun herpesin gjenital gonorrenë hepatitin B HIV sifilizin lythat gjenitalë.
Disa infeksione të shkaktuara nga bakteret apo virusi mund të kalohen përmes seksit oralanal, si hepatiti A dhe E.coli. Gjithashtu ISTtë transmetohen nga futja e gishtit në anusin e partnerit.
